Pembungkusan adalah bahagian tengah reaktor biofilm, yang menjejaskan kesan rawatan dan kawalan operasi teknologi, jadi sangat penting untuk memilih pembungkusan yang sesuai untuk reaktor biofilm. Bentuk pengisi biasanya digunakan pada masa lalu termasuk honeycomb, bundle, beralun, jejari bulat, perisai, bersih, silinder, granular biasa dan granular yang tidak teratur, dan lain-lain. Data kesan pada dasarnya dipilih kecuali pengisi granular. FRP, PVC, polipropylene, vinlon, dll. Kerana faktor pembuatan dan ekonomi.
Pada masa ini, pengisi yang akan dipilih adalah pengisi plastik atau gentian kaca bertetulang plastik honeycomb, pengisi wavy tiga dimensi, pengisi serat lembut, pengisi separa lembut, pengisi plastik atau gentian kaca bertetulang pengisi honeycomb plastik. Permukaannya lancar, kadar pelekat biofilm kurang baik, dan ia mudah diturankan. Dan ia biasanya mudah dalam penggunaan sebenar. Pengisi tersumbu berlaku. Keadaan aliran air dalam pengisi lembut tidak cita-cita, dan mudah dipeluk oleh filem mikrob, menyebabkan fenomena bola, yang sangat mengurangkan jumlah permukaan yang berguna, dan kemudian adegan anaerobik berlaku di dalam bola, yang menjejaskan kesan rawatan.
Bentuk pengisi atau bahan penapis seramsite yang diperbuat daripada bahan imobilisasi mikrob secara langsung menentukan saiz kawasan permukaannya. Dalam keadaan biasa, lebih besar jumlah ruang pengisi dan bahan penapis biofilm tunggal, ertinya kawasan permukaan khususnya. Ketumpatan relatif menjejaskan kos pembinaan dan penggunaan tenaga struktur rawatan. Jika ketumpatan relatif lebih besar, lebih banyak kuasa diperlukan untuk penambahbaikan. Pada masa yang sama, lembaran hidraulik yang berlebihan menjejaskan imobilisasi mikroorganisma. Kekok dan kekasaran pengisi biofilem secara langsung mempengaruhi pembentukan, pembangunan dan kestabilan biofilem. Menambah kawasan yang berguna pengisi dan mikrob boleh melindungi mikrob tetap dari kesan rumput hidraulik, melambatkan kehilangan mikrob yang disebabkan oleh perlanggaran antara pengisi, dan sedikit sebanyak memudahkan peningkatan kuasa pemindahan besar-besaran.